Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAPO00193 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAPO00193 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAPO00193 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAPO00193 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAPO00193 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAPO00193 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMAPO00193 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAPO00193 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms