Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA8SH3BPF8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA8SH3BPF8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA8SH3BPF8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms