Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
E9PCH4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
E9PCH4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
E9PCH4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
E9PCH4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
E9PCH4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
E9PCH4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
E9PCH4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
E9PCH4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
E9PCH4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
E9PCH4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
E9PCH4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
E9PCH4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
E9PCH4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
E9PCH4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
E9PCH4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
E9PCH4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
E9PCH4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
E9PCH4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
E9PCH4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
E9PCH4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
E9PCH4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
E9PCH4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
E9PCH4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
E9PCH4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
E9PCH4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
E9PCH4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
E9PCH4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
E9PCH4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
E9PCH4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
E9PCH4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
E9PCH4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
E9PCH4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
E9PCH4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
E9PCH4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
E9PCH4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
E9PCH4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
E9PCH4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
E9PCH4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
E9PCH4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
E9PCH4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
E9PCH4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
E9PCH4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
E9PCH4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms