Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM2-AKAP2B1ALY0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms