Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3P2A8K0S8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3P2A8K0S8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms