Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00473A8K010 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00473A8K010 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms