Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC22A20A6NK97 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC22A20A6NK97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms