Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AGAP5A6NIR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AGAP5A6NIR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms