Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEMP2A6NFY4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEMP2A6NFY4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEMP2A6NFY4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms