Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM247A6NEH6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM247A6NEH6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM247A6NEH6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms