Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6CA6NDK9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA6CA6NDK9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6CA6NDK9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6CA6NDK9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms