Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49BA6NDI0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM49BA6NDI0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM49BA6NDI0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms