Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NCN8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NCN8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NCN8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NCN8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NCN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A6NCN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A6NCN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NCN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NCN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NCN8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A6NCN8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NCN8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NCN8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NCN8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NCN8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NCN8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A6NCN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A6NCN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A6NCN8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A6NCN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A6NCN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A6NCN8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A6NCN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms