Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GMNCA6NCL1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GMNCA6NCL1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms