Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00862A6NCI5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00862A6NCI5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms