Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VWA8A3KMH1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VWA8A3KMH1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VWA8A3KMH1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms