Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC78A2IDD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC78A2IDD5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC78A2IDD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms