Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPDC1A2A3K4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPDC1A2A3K4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms