Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN11A1L157 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN11A1L157 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN11A1L157 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms