Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POTEB3A0JP26 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms