Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0U1RQJ8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQJ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms