Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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