Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54L2Q9Y4B4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms