Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTF2Q9UNY4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms