Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
L1RE1Q9UN81 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms