Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms