Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LHX3Q9UBR4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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