Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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