Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC180Q9P1Z9 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC180Q9P1Z9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms