Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms