Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCSER1Q9C0I3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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