Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRIM4Q9C037 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRIM4Q9C037 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TRIM4Q9C037 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM4Q9C037 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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