Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH12-201ENST00000231484 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms