Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB2BQ9BVA1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms