Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLRP3Q96P20 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms