Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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