Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms