Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C16orf54Q6UWD8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms