Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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