Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms