Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCAF6Q58WW2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms