Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms