Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRIM16LQ309B1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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