Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERCC6LQ2NKX8 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms