Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL24A1Q17RW2 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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COL24A1Q17RW2 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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COL24A1Q17RW2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL24A1Q17RW2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL24A1Q17RW2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL24A1Q17RW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL24A1Q17RW2 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL24A1Q17RW2 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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