Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HERC3Q15034 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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