Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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