Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms