Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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