Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HDAC1Q13547 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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